2010年7月12日 星期一

Something Deeply Wrong With Chemistry (Science)


加州理工學院化學系老師給博士後的一封信,信裡直接了當的闡述了老闆們的中心思想。


我翻譯信件原文如下:

我想要以書面的方式來告訴你,我對於你身為研究團隊成員的期望。除了一般的工作日之外,我期望大家可以在晚上以及週末來工作。你會發現這在加州理工學院是一種常態。我了解你偶爾需要花一些時間離開你的實驗去處理你的個人事務。然而我不會允許這變成一種習慣。

我已經注意到你好幾個禮拜的週末都沒有來實驗室,最近晚上也沒有出現。除此之外,你最近還要求要有一些休假。我對於應該放的假沒什麼意見,但是連續休假與沒有來實驗室影響到實驗計畫的進行,我就有意見了。

我希望你能立即改正你的工作態度。

我每天從美國與世界各地至少收到一個博士後的應徵。如果你沒辦法達成預期中的工作進度,我很確定我會找合適的人選來取代你做這個重要的計畫。

2010年5月16日 星期日

到 The Book Depository 買外文書

越長越大就越發現,很多書看中文翻譯的沒有辦法獲得看原文時的感覺,雖然自己英文閱讀能力不是說很好,但原文看多了之後,中文書就不會想看了。除了有時候想看看別人怎麼翻譯的之外,實在沒有想看中文的動力。

所以第一個問題是作者的原意很容易因為翻譯的過程而流失;第二個問題是,有些書就算你想看中文版也沒辦法,因為繁體中文市場裡會看這類書的人太少,自然沒有出版社會代理來翻譯。於是乎想要看不是那麼熱門領域的書的話,想要跟上世界潮流的腳步,還是要看外文。久而久之,似乎有沒有中文也無所謂了 XD。

看外文書在台灣感覺是這幾年才比較方便的事,博客來可以訂得到,誠品或是 PageOne 說不定就有在賣 (金石堂感覺還是只是在賣暢銷書而已)。不過很多情況下,上面這些商家還是沒有辦法找到你想要的書,這時候就要找 Amazon 了。可是大家都知道 Amazon 的運費很貴,每本書還要另外加收處理費,如果用最便宜的運費,一次要 4.99 美金 (約 160 台幣),每本處理費亦要 160 台幣。也就是單買一本書要多 320 塊運費,這還是最陽春最慢的寄送方式 (需 17-30 個工作天),如果要快一點,則要 29.99 美金 (約 960 台幣 ),不過只要 3-6 個工作天就寄到了。

詳細可以參考 Amazon 的 Shipping Rates and Times to Asia & Pacific Islands
總括一點,去 Amazon 雖然是什麼鬼書都能找得到,不過運費極貴。

Sean Carroll 的新書 Remarkable Creatures 為例。用 Findbook 比價如下圖:


博客來的算法是美金定價 x 35=台幣定價,是 523 塊。但是現在美元匯率大約是 31.735 左右,跟原價有 4, 50 元的差距。不過好處是不需要運費,算起來還是比 Amazon 便宜多了。而這本書誠品找不到。

再看看 Sean Carroll 很有名的一本 Evo-Devo 科普書:Endless Forms Most Beautiful。用 Findbook 比價如下圖:

博客來要 593 塊,誠品網網路書店因為有打九折,所以比博客來便宜一些,是 536 塊。Amazon 的網站打七折,再以 1: 32 來換算,大約就是 Findbook 上的 371 塊,便宜超多。不過你也看到,光運費就要 321 塊 (前面所說的一次運費跟一本書處理費 160+160=320),運費都可以再買一本了。看到這裡你難道不覺得買個外文書真是勞民傷財、不公不義嗎?XD

還好有一個有良心的英商公司,The Book Depository 聽到了我們小小異國消費者的心聲,提出了全球免運費的這種好康。沒錯,就是寄到全世界都免運費,不管你買幾本都免運費,就算買一本也免運費,目前已有 100 個國家包含在內,詳見 Free delivery worldwide as standard。文末還加上一句:We're sorry if your country isn't on the list, we are of course happy to take an order for delivery in a country we do ship to if you're in a location we cannot currently support. 看來那 100 個國家是跟他們買過書的地方,如果你不在那 100 個國家之內,他們還是願意免費寄給你的。

有了這麼好康的管道,先來看看剛剛提到的那兩本書要多少錢吧!免運費還不打緊,他們的書照樣有打折,這就厲害了。

第一本 Remarkable Creatures,原價 14.95 美金,打 84 折,折完下來 12.51,算一算只要 397 塊台幣,還記得剛剛找到最便宜的在博客來也要 523 塊嗎?現省了 126 塊。
第二本 Endless Forms Most Beautiful,原價 17.46 美金,打 81 折,折完下來 14.11,算一算只要 448 台幣,536-448 = 88,現省 88 塊。 真是省很大。

而且訂單下了之後,48 小時之內會寄出,兩週之內會寄到,感覺就是一整個方便,就算跟博客來定,也是跟這時間差不多,還有可能會更晚,所以我想我以後應該都會考慮在這裡買書了。

另外買書的流程也非常簡單,可以使用 Paypal 或是信用卡,不用加入會員,直接放在購物車結帳就 ok 了。如果選用 Paypal 付款更簡單,因為地址跟收件人之前在註冊 Paypal 時就已經填過,只要輸入 Paypal 帳號跟密碼就可以買書了,非常方便,又不需要填卡號與其他資料,非常建議使用 Paypal 來付款。(話說 The Book Depository 應該給我廣告費才對XD)

TED 的演講與翻譯

TED 是 technology, entertainment 與 design 的縮寫。
每年三月會開一個 TED 大會,邀請各領域傑出的人士來演講。
內容不侷限於科技、娛樂、設計等原來的範疇,也包含教育、文化、商業、藝術等。
如前一陣子蠻有名的天賦自由,其作者 Ken Robinson 也有受邀到該會演講。
中文標題譯為:肯尼•羅賓森問,學校扼殺了創意嗎?

比較有名的演講還有神經解剖學家 Jill Bolte Taylor〈你腦內的兩個世界〉
(後來該演講大受歡迎,她還出了書,名叫 My Stroke of Insight: A Brain Scientist's Personal Journey,亦有中文翻譯,叫《奇蹟》,楊玉齡譯。)、分析家 Richard St. John〈談成功的 8 個祕訣〉等,從他們被翻譯成幾種語言就知道這些演講的影響力。

個人覺得 Paul Rothemund〈詳細解說 DNA 摺疊術〉也非常有趣。 總之就是聽 TED 的演講算是讓人可以大開眼界,蠻多特別點子跟不一樣的思考邏輯。

TED 有一個開放翻譯計畫 (TED Open Translation Project),註冊後會利用 dotSUB 有一句一句的英文字幕檔可以對著照翻,算是蠻方便的。由下圖可以看得出來,巴西與中國的翻譯數目近來急遽增長,由此可看出金磚四國還真不是蓋的。他們的文化水平正以極快的速度在上升當中。


TED 的翻譯有兩個階段,類似 peer-review 的機制,但卻又不那麼嚴格,選擇的演講若沒有人翻譯過,則你就成為了翻譯者。在選擇了想要翻譯的演講之後,必須在 30 天內完成,否則將會把機會讓給其他的人來翻譯。此外,翻譯完成之後並不會馬上被放上 TED,而是等到有人 review 你,確定沒有問題之後,才會正式將翻譯放上 TED 的網站。翻譯是沒有錢拿的,但是 TED 會在網站上給翻譯跟覆閱的人 credit,把兩者的名字都放在網路上面。

大家有空來翻譯吧!可以傳播想法,又可以練練英文。而且 TED 的演講規定講者只能講 18 分鐘,所以都還蠻短的,不會太花時間,review 的話花的時間更短。

我自己前一陣子試著 review 這篇 〈Craig Venter 即將實現人造生命〉,這一則大概花了兩個晚上左右。最近比較沒空,有空的時候再多翻譯幾篇,介紹幾個好的演講給大家。

科學與偽科學

(原發佈日期 2010年2月22日 2:29)

個人蠻討厭偽科學的,偽科學有以下幾項特徵:(來自 Wiki)
http://zh.wikipedia.org/zh-tw/%E5%81%BD%E7%A7%91%E5%AD%B8

1. 沒有實驗證據就進行斷言
2. 在存在矛盾實例的情形下進行斷言
3. 不能進行重複性實驗
4. 斷言不合邏輯
5. 在存在多種可能解釋的情況下僅取其一

相對的來說科學的方法就自然有他的邏輯跟證據可循了。
Wiki 英文版裡頭 "科學的方法" 詞條資料非常豐富
http://en.wikipedia.org/wiki/Scientific_method

一般科學界目前常用程序如下:

1. Define the question
2. Gather information and resources (observe)
3. Form hypothesis
4. Perform experiment and collect data
5. Analyze data
6. Interpret data and draw conclusions that serve as a starting point for new hypothesis
7. Publish results
8. Retest (frequently done by other scientists)

最後提到蘋果,是許多有踢爆精神的人,像蘋果日報一般報
導了非常多偽科學的事件,隨意舉例如下:
第一號人物: 方舟子
http://zh.wikipedia.org/zh-tw/%E6%96%B9%E8%88%9F%E5%AD%90

方舟子的博客
http://blog.163.com/fangzhouzi_vip/

聯合踹人天地
http://www.wretch.cc/blog/mocear

水的科學與偽科學
http://chem.ncue.edu.tw/huch/water/water.htm

揭揭伪科学的皮 (水知道答案的评论)
http://www.douban.com/review/1110842/

Caltech 研究冰晶學者的網站
http://www.its.caltech.edu/~atomic/snowcrystals/

人太理性,有時候很容易 over 過了頭,就成了偏執,不過就算是這樣,也不能黑的說成白的,是吧?算是警惕自己很多東西不能盲從盲信,不過這樣的人生是比較累一點就是了。

看 "揭揭伪科学的皮" 上的回文就知道了。


  爱~人活成你这么明白,应该很累吧~~~
  就算书里是假的,我也宁愿相信这个温情的谎言~


我相信大部分的人都對事實沒有興趣,寧願相信溫情的謊言
唉,人活成我這麼明白,有時候還真是累阿!

Custom error bar in Excel 2007&2008

(原發佈日期 2009年9月9日 1:54)

2003 之前的版本都有 custom error bar 的功能,也就是可以選擇自己算好的 standard deviation 或是 standard error 來做 error bar。

但是 2007 跟 2008 版這個選項就不見了,ptt 有人零星問了這個問題,但是沒有人回答,我最近剛好也遇到這個問題,研究了一下,依 Mac 跟 Win 系統不同,提供解決方法如下:

1. 使用 Error Bar Add-In
http://peltiertech.com/WordPress/error-bars-in-excel-2007/

文章中有個 ErrorBars.zip 檔 (用 Ctrl+F 找)
下載下來後,依照以下指示安裝 Add-In 到 Excel 中
http://peltiertech.com/WordPress/installing-an-add-in-in-excel-2007/

2. 更新 Office 至少到 SP1 (目前最新 SP2)
SP2 for Mac
http://tinyurl.com/nr6mov
SP2 for Win
http://tinyurl.com/l764zf

SP1 其中一項 update 是:
Custom Error Bars.
Restored formatting option on the Error Bars panel for data series

3. 直接使用其他 Office 系統 (free)
NeoOffice (for Mac)
http://www.neooffice.org/neojava/en/index.php
OpenOffice (for Win)
http://www.openoffice.org/

重讀自私的基因

(原發佈時間 2010年2月22日 2:13)

第一次看這本書是在高中一年級 1998 年的時候在重慶南路的金石堂,天下文化出版,趙淑妙譯 (查了一下才發現原來她人在中研院生多中心,哇),道金
的邏輯震撼了當時我這個小小高中生,於是用他的觀念去看生物課本,還得到蠻多自以為是的見解,重點是,它開啟了我對生物和演化的興趣。

(中文版似乎去年又再版了)
http://www.books.com.tw/exep/prod/booksfile.php?item=0010434855

沒想到 10 多年後,這本書種下了因,讓一個什麼都不懂的高中生,就這樣經過了一連串生物學上的訓練,變成以生物研究來混口飯吃的現在的我。總之是一本影響我蠻深遠的書,雖然他老兄講話有時候是有點蠻尖酸刻薄得理不饒人的,不過正是這樣才對我的胃口。

前一陣子逛誠品在一個角落剛好看到在賣科普原文的書,有這本 The Selfsifh Gene 2006 年三十週年版 (話說這本書是 1976 年的時候出的,沒有個人電腦、沒有基本分生工具的年代),順手就把他買起來了。

重讀感覺起來蠻不一樣的,生物科學在這 30 年之內發展得相當快速,道金斯本人為新版寫序的時候重新解釋了為什麼書名取作自私的基因,而且自認為他的理論到目前為止都是 ok 的,並將天擇選擇的單位 (unit of selection),基因與個體都並重地討論,文中比喻基因就像是複製器 (replicator),而個體是載具 (vehicle)。不過這是序文,基本上內文主要還是以基因選擇立論為主,這有他的時代背景原因就是了。

Wiki 了一下,現今關於 unit of selection,已經有很多的意見了。比方說,基因、細胞、個體、甚至群體都有可能是天擇發生的單位。因為本身沒有在做演化的研究,對演化的了解其實也不是很深,最後註記一些 Wiki 的詞條幫助自己溫故知新一下。

The Selfish Gene
http://en.wikipedia.org/wiki/Selfish_gene

Evolution
http://en.wikipedia.org/wiki/Evolution

Unit of selection
http://en.wikipedia.org/wiki/Unit_of_selection

Gene-centered view of evolution
http://en.wikipedia.org/wiki/Gene-centred_view_of_evolution

Altruism
http://en.wikipedia.org/wiki/Altruism

Amotz Zahavi
http://en.wikipedia.org/wiki/Amotz_Zahavi

文獻管理軟體 Zotero

原建立日期 2010年2月18日 1:32
(Facebook 的 blog 太不好用了,以後都在這邊寫吧。此文是舊文轉貼,加上一些 links)

碩班的時候,因為要整理很多的文獻,於是使用了 EndNote,但是它有一個很麻煩的地方,就是你建立
Library 的時候,需要手動 Key in,或者到網路上面下載 Reference 的檔案再匯入,後來改版得怎麼樣我不清楚,不過這樣子顯得太麻煩,後來乾脆不用了。改成直接下載 PDF 檔,檔名就直接用文獻標題,分門別類到不同檔案夾,再利Google Desktop,用印象中的關鍵字來找。

後來轉用 Mac,發現了 Papers,這個軟體炫的地方在於它可以將下載好的 PDF 以拖曳的方式匯入 Library,並且可以自動掃描 PDF 檔上的內容,連至相關的資料庫搜尋該篇文獻的 Ref 檔。我蠻喜歡這種直覺的文獻整理方式,但是壞處是,他沒有辦法選擇文獻的輸出格式,亦無法支援文書作業軟體。若要使用這些功能,還是要搭配 EndNote 來使用,搞半天,還是走回原點。

後來乾脆什麼文獻管理軟體都不用了,都用土法煉鋼的方式,在家裡看 paper 的話就將找到的文獻它的標題跟網址貼到 txt 檔,到實驗室之後再下載 PDF 檔,下載下來的檔案依照類別放到不同的檔案夾,跟之前整理的方式一樣。

最近因為沒在寫東西,這樣整理起來還算 ok。不過等到真的想要寫點東西,或是文獻一但開始多起來,這種整理方法就越來越沒效率了。心裡想,NOKIA 說科技始終來自於人性,我的想法跟我的需要,應該也是許多人的想法才是,於是找了一下 Wiki,果然有 Comparison of reference management software 這個詞條。


在這裡不得不佩服神通廣大的網友們,真是無所不知阿。裡面將目前市面上所有的文獻管理軟體做了比蘋果報還詳細的評比。其實我的需求還蠻簡單的,大概是以下幾點:

1. 免費 (不想花了錢買又覺得不好用或不實用)
2. 跨平台 (Windows、Mac 兩邊跑)
3. 邏輯直覺化 (比方說 PDF 直接匯入的功能,不用老是手動 Key in)
4. 支援文書作業軟體 (這樣寫起文章來才有實用性)
5. 支援各式文獻格式輸出 (同 4. 這樣才有實用性而且方便)

我想這五點應該可以算是未來軟體發展的走向跟趨勢了,免費、跨平台、直覺式的操作,支援相關軟體的相互整合與各種格式的輸入輸出。一個好的軟體本來就應該這樣!

最後找來找去,找到了 Zotero,它是一個 FireFox 的外掛,不過功能卻很強大,令人滿意的是它竟然完全符合我上面的需求,Google 了一下它,才知道自己井底之蛙,卻又帶點相見恨晚之感。

Zotero 官網
http://www.zotero.org/

不過既然網路上已經有人整理好了 Zotero 的各種資料,小弟就轉貼給大家參考參考吧!

1. Zotero 安裝教學
http://yimi.pixnet.net/blog/post/23376833
http://140.112.54.131/2009/07/zotero-%E5%AE%89%E8%A3%9D%E6%95%99%E5%AD%B8

2. Zotero 特色介紹
http://research.funp.tw/?postag=Zotero

3. 另外一款文獻管理軟體--Zotero
http://www.training.idv.tw/~land/blog/index.php?op=ViewArticle&articleId=74&blogId=2

4. EndNote與Zotero的比較
http://www.training.idv.tw/~land/blog/index.php?op=ViewArticle&articleId=78&blogId=2

5. 將Zotero文獻格式改成英文
http://newgenerationresearcher.blogspot.com/2008/10/zotero_13.html

Google 上還有蠻多中文的資訊的,有興趣再去研究看看吧。
最後來個 Kuso 的連結:

十大拒絕使用Zotero的理由
http://yamje.blogspot.com/2007/10/zotero-ten-reasons-for-not-using-zotero.html

相信你看完之後馬上會有想試用看看的衝動了,沒騙你,真的很好用喔。
而且它可以整理的,似乎不只有文獻而已,就等你慢慢開發吧。